EPIDEMIOLOGI PENYAKIT TUMBUHAN
Ketahanan vertikal
Masa kini, banyak digunakan benih atau bibit yang mempunyai ketahanan
vertikal untuk mengejar hasil panen yang tinggi. Dari segi epidemiologi, ada
beberapa hal yang perlu diperhatikan dalam menggunakan ketahanan vertikal,
yaitu sebagai berikut :
1. Adanya variabilitas vertikal dari inang. Ketahanan vertikal mudah diterapkan
pada tanaman semusim, misalnya : cerealia, legum, sayuran, kentang, tomat,
tembakau, kapas, dan tanaman semusim lainnya. Untuk tanaman setahun atau
setengah keras, misalnya : tebu, pisang dan beberapa buah-buahan sulit
diterapkan, sedangkan untuk tanaman tahunan (keras), misalnya : teh, kopi,
kakao, karet, jeruk, apel, kelapa, dan tanaman hutan sangat tidak praktis atau
sama sekali tidak dapat dilaksanakan. Perlu diperhatikan juga tentang
kemudahan untuk mengadakan pemuliaan. Variabilitas vertikal tanaman inang
mempunyai perbedaan individual antara spesies tanaman. Tebu yang lebih
mudah dimuliakan mempunyai variabilitas vertikal yang tinggi dibanding
triploid pisang yang lebih sulit dimuliakan.
2. Tipe epidemi penyakit tanaman. Adanya dua tipe epidemi yang secara
matematik analog dengan bunga tunggal dan bunga majemuk dalam pinjam
meminjam uang di Bank. Ketahanan vertikal lebih mempunyai arti terhadap
penyakit tipe bunga tunggal dari pada tipe bunga majemuk. Fusarium,
Verticillium, dan layu bakteri merupakan penyebab penyakit tipe bunga
tunggal, sedangkan Phytophthora pada kentang merupakan penyebab penyakit
bunga majemuk.
3. Mutabilitas patogen atau kemudahan patogen mengalami mutasi. Ketahanan
vertikal agak tidak berarti terhadap patogen yang mempunyai mutabilitas
vertikal yang tinggi. Mutabilitas vertikal dapat terjadi pada patogen tipe bunga
tunggal maupun tipe bunga majemuk. Synchitrium endobioticum dan beberapa
Fusarium mempunyai mutabilitas vertikal yang rendah, sedangkan
Pseudomonas solanacearum mempunyai mutabilitas vertikal yang tinggi.
Diantara penyakit tipe bunga majemuk Fuccinia graminis mempunyai
mutabilitas vertikal yang lebih rendah jika dibandingkan Puccinia polysora
dan Phytophthora infestans yang dapat menghasilkan patotipe vertikal dalam
satu musim dengan populasi yang sangat kecil. Ketahanan vertikal terhadap
penyakit, baik di lapangan maupun di laboratorium akan cepat dipatahkan.
4. Keragaman genetik tanaman inang. Ketahanan vertikal tidak begitu
mempunyai arti apabila populasi tanaman inang yang secara genetik seragam
(uniform) ditanam dalam areal yang luas sebagai kultivar tunggal (monokultur)
Misalnya pada pertanaman gandum, jumlah populasi patogen (Puccinia
antirhini dan Puccinia graminis) dari suatu daerah biasanya sedikit, gennya
campuran dan jarang, tekanan seleksi pada patotipe vertikal yang baru akan
kecil, sebaliknya populasi tanaman gandum yang luas, gennya seragam dan
rapat maka seleksi pada patodem vertikal yang baru sangat besar, sehingga
ketahanan vertikal tanaman gandum akan patah.
5. Pola tanam dan pola waktu tanam. Pola tanam dari ketahanan vertikal di
lapangan adalah sangat penting terutama untuk menghadapi penyakit tipe
bunga majemuk. Monokultur mempengaruhi tekanan seleksi terhadap patogen
tertentu, menghindari monokultur merupakan salah satu cara pengendalian
penyakit tipe bunga majemuk. Pola waktu tanam dari pertanaman yang
memiliki ketahanan vertikal merupakan langkah sangat penting terutama
untuk menghadapi penyakit tipe bunga tunggal. Dalam rotasi tanaman, satu
atau lebih gen yang kuat untuk ketahanan vertikal harus tersedia untuk
menjamin bahwa tekanan stabilitas bekerja secara maksimal.
6. Alat perbanyakan tanaman inang. Ketahanan vertikal kurang berarti untuk
menghadapi penyakit yang ditularkan melalui alat perbanyakan vegetatif
inang. Beberapa penyakit ditularkan melalui alat-alat vegetatif. Bila alat-alat
perbanyakan vegetatif tersebut mempunyai ketahanan vertikal, maka akan
diikuti penularan patotipe vertikal yang sesuai. Inokulum awal kemudian
menjadi berkembang dan pengaruh ketahanan vertikal akan hilang.
7. Tingkat perlindungan ketahanan. Ketahanan vertikal akan cepat patah jika
perlindungan untuk ketahanan yang diberikan tidak sempurna.. Mekanisme
ketahanan vertikal harus memberi perlindungan yang sempurna terhadap
patotipe, tetapi kalau tidak sempurna akan kurang mempunyai arti dan
berbahaya (sangat mudah dipatahkan ketahanannya).
8. Musim atau iklim. Ketahanan vertikal akan lebih mempunyai nilai apabila ada
musim yang menutup, misalnya musim kemarau yang panjang, akan
mengurangi populasi patogen patotipe baru. Hal ini sangat penting terutama
untuk menghadapi parasit obligat tipe bunga majemuk pada tanaman semusim.
Pada tanaman tahunan tetap tidak berguna dalam menggunakan ketahanan
vertikal meskipun ada musim yang menutup karena masih tersedianya jaringan
inang secara berkesinambungan (continue) selama musim kemarau, sehingga
patotipe baru tetap berkembang.
9. Pelaksanaan pengendalian legislatif. Ketahanan vertikal akan lebih
mempunyai arti jika pengendalian legislatif berjalan sesuai dengan peraturan
yang berlaku. Pengendalian legislatif antara lain larangan penanaman patodem
vertikal tertentu untuk mempertahankan kekuatan ketahanan vertikalnya.
Misalnya kultivar ketang dengan ketahanan vertikal terhadap penyakit kutil
(Synchitrium endobioticum). Patogen tersebut merupakan patogen golongan
parasit obligat dan mekanisme ketahanan vertikal kentang memberi
perlindungan sempurna terhadap patotipe vertikal yang tidak sesuai. Di bawah
keadaan tersebut patogen dapat mempertahankan diri hanya dalam bentuk
spora istirahat yang merupakan patotipe vertikal asli, sehingga tidak dapat
dihasilkan patotipe vertikal baru dan ketahanan vertikal tak dapat dipatahkan.
Bentuk lain pengendalian legislatif yang dapat mempertahankan nilai
ketahanan vertikal adalah sertifikasi kesehatan benih dan pengendalian pola
pertanaman.
10. Tingkat penggunaan ketahanan horizontal. Ketahanan vertikal tampaknya
lebih mempunyai arti jika diperkuat dengan tingkat pengunaan ketahanan
horizontal. Tingkat ketahanan horizontal biasanya nilainya sangat rendah,
tetapi ketahanan vertikal dapat dipertinggi secara menyolok jika diperkuat
dengan tingkat ketahanan horizontal yang berguna. Suatu contoh kultivar
kentang vertifolia yang diseleksi untuk ketahanan vertikal terhadap
Phytophthora infestans telah kehilangan ketahanan horizontalnya dalam
proses pemuliaan, sehingga akibatnya paada waktu ketahanan vertikalnya
patah maka kultivar vertifolia sangat rentan terhadap Phytophthora. Fenomena
seperti ini disebut ‘vertifolia effect’.
Sepuluh hal tersebut di atas akan sulit dimengerti jika tidak ada ilustrasi
dalam praktek. Beberapa contoh dalam praktek akan disampaikan berikut ini
agar dapat diidentifikasi aturan-aturan di atas dengan cara diberi nomor dalam
kurung.
a. Layu Fusarium oxysporum. Patogen ini merupakan parasit fakultatif dari tipe
bunga tunggal (2). Tanaman inangnya adalah tanaman semusim (1) yang
paling sedikit diketahui ada satu gen yang kuat, sehingga rotasi tanaman dapat
dilakukan (5), dan pengendalian secara sempurna dapat dimungkinkan dengan
ketahanan vertikal. Pengendalian yang demikian dapat berhasil pada tanaman
tomat dan kobis, tetapi akan gagal jika rotasi tanaman tidak dijalankan.
Pengendalian yang demikian tidak berhasil pada tanaman pisang panama
terhadap penyakit panama (Fusarium oxysporum), karena pisang merupakan
tanaman setahun (setengah keras) yang sangat sulit dimuliakan (1) dan
ditanam dalam areal yang luas dengan klon tunggal (4) dan penyakit juga
ditularkan melalui bahan vegetatif (6).
b. Layu bakteri yang disebabkan oleh Pseudomonas solanacearum. Ketahanan
vertikal terhadap penyakit ini telah dipersiapkan pada kentang, akan tetapi
tidak mempunyai nilai karena patogen mempunyai mutabilitas vertikal yang
tinggi (3), kekurangan gen kuat, penyakit menular melalui umbi sebagai bibit
(6) dan kesulitan untuk mencapai pengendalian legislatif yang cocok (9) di
daerah pertanian tropika di mana penyakit tersebut menimbulkan kerugian.
Kenyataannya, strain SFR dari patogen telah berubah dari tipe bunga tunggal
menjadi tipe bunga majemuk (2)
c. Karat kopi yang disebabkan oleh Hemileia vastatrix. Spora dari karat kopi
ditularkan melalui air. Hal ini berarti bahwa pada skala perkebunan, individu
populasi inang adalah pohon tunggal dan karat merupakan penyakit tipe bunga
tunggal. Pada skala pohon tunggal, individunya adalah daun tunggal dan karat
adalah penyakit bunga majemuk (2). Oleh karena itu pola dalam ruang tidak
mempunyai arti, karena kopi merupakan tanaman tahunan jangka panjang (1),
terdapat jaringan inang secara berkesinambungan (6) yang akan membawa
patotipe vertikal yang sesuai, sehingga pola dalam waktu (5) tidak dapat
dilakukan. Penggunaan ketahanan vertikal terhadap karat kopi sangat
membawa resiko, akan tetapi resiko ini dapat dikurangi karena mutabilitas
patogen (3) sangat rendah, disamping dimungkinkan mengurangi patogenisitas
horizontal dengan ketahanan vertikal yang kompleks. Di Pantai Gading telah
berhasil dikembangkan kopi Arabusta yang tahan terhadap Hemileia vastatrix
strain Afrika barat, kopi ini hasil persilangan kopi Arabika dan Robusta dan
menghasilkan kopi rasa Arabika dengan ketahanan Robusta.
d. Penyakit hawar daun pada kentang yang disebabkan oleh Phytophthora
infestans. Penyakit hawar daun kentang merupakan penyakit tipe bunga
majemuk (2) yang disebabkan oleh patogen dengan mutabilitas vertikal yang
tinggi (3) yang dibawa oleh bagian-bagian vegetatif kentang (6) dari
pertanaman yang secara genetik seragam (4). Faktor-faktor tersebut lebih
menguntungkan kentang sebagai pertanaman semusim yang mekanisme
ketahanan vertikalnya memberikan perlindungan sempurna terhadap patotipe
vertikal yang tidak sesuai (7) dari parasit obligat. Beberapa gen yang kuat
diketahui, ketahanan vertikal terhadap penyakit hawar daun sedemikian jauh
gagal untuk mengendalikan penyakit, akan tetapi kemungkinan pola
pertanaman (5) dan penguatan kembali dengan ketahanan horizontal (10)
dapat menolong.
e. Karat tropika pada jagung yang disebabkan oleh Puccinia polysora. Penyakit
karat jagung merupakan penyakit tipe bunga majemuk (2) yang disebabkan
oleh patogen dengan mutabilitas vertikal yang tinggi (3), sehingga ketahanan
vertikal tanaman terhadap karat jagung tropika cepat patah dan tidak bernilai
lagi. Jagung merupakan tanaman dengan gen yang beraneka ragam dan
bersifat polinasi terbuka, sehingga menghasilkan tingkat ketahanan horizontal
yang memadai. Oleh karena itu ketahanan vertikal akan tidak berguna dan
bahkan tidak diperlukan.
5.5. Budidaya tanaman
Untuk meningkatkan produksi bahan makanan dilakukan usaha budidaya
yang intensif (intensifikasi) dan perluasan areal (ekstensifikasi). Perubahan
lingkungan dari cara budidaya tradisional ke cara budidaya dengan teknologi
moderen mengundang resiko penyakit tanaman yang harus diperhitungkan.
Penggunaan tanah atau lahan yang bebas dari penyebab penyakit harus
diartikan bahwa tanah atau lahan tersebut relatif atau sama sekali bebas dari
patogen yang dapat merugikan jenis tanaman yang akan dibudidayakan atau
ditanam dan boleh mengandung patogen tanaman lain. Di Bengkulu banyak
tanah bukaan baru, seperti bekas alang-alang atau bekas hutan sering merupakan
tanah atau lahan yang bebas patogen tergantung dari jenis tanaman yang akan
dibudidayakan. Tanah bekas hutan akan merupakan tanah atau lahan yang dapat
sangat berpotensi terhadap penyakit jika lahan tersebut kemudian dibudidayakan
tanaman tahunan juga, seperti : karet, kopi, teh, kakao, kelapa sawit dan
tanaman tahunan lainnya, karena pada lahan tersebut akan ada sisa-sisa patogen
akar dari pohon hutan yang dapat merugikan tanaman tahunan yang
dibudidayakan.
Parasit yang terutama menyerang tanaman subur biasanya adalah parasit
obligat, yang hidupnya sangat tergantung kepada sel-sel hidup, seperti : patogen
karat (Puccinia arachidis) pada kacang tanah, patogen karat jagung (Puccinia
polysora), patogen bulai jagung (Scleroperonospora maydis), patogen tepung
pada karet, jeruk, tembakau (Oidium spp.), patogen cacar pada teh
(Exobasidium vexans), patogen karat pada kopi (Hemileia vastatrix), serta
paenyakit-penyakit yang disebabkan oleh virus, mikoplasma dan spiroplasma
pada macam-macam tanaman semusim maupun tahunan. Pemakaian nitrogen
yang terlampau banyak tidak mempunyai pengaruh langsung terhadap
timbulnya karat tetapi akan meningkatkan jumlah daun dan kandungan air.
Intensitas penyakit dan kerentanan tanaman sangat dipengaruhi oleh
penggunaan nitrogen. Penyakit karat dan tepung dirangsang oleh N dari nitrat
(NO3) tetapi dihambat oleh N dari amonium (NH4). Bertambahnya berat
serangan penyakit tepung sebagai akibat dari NO3 dibarengi dengan
bertambahnya luas daun. Meskipun demikian ketahanan daun, yang tergantung
kepada umur, dapat meningkat lagi sebagai hasil penambahan penggunaan
bentuk nitrogen. Patogen Desclera turcica pada jagung, justru timbulnya
penyakit pada varietas yang resisten (tahan) akan lebih berkurang karena NO3,
sebaliknya penggunaan NH4 pada varietas padi yang rentan akan menambah
timbulnya Pyricularia oryzae.
Tanaman yang lemah atau yang tumbuh pada tanah kurang subur mudah
menderita penyakit fisiologis dan mudah diserang oleh parasit-parasit lemah
yang biasanya menyebabkan bercak daun dan busuk akar. Pada tanah-tanah
yang baru sedikit mengalami pelapukan dengan pH rendah (asam) akan
menguntungkan untuk hidupnya jamur-jamur akar, sedangkan tanah-tanah
dengan pH tinggi (5,2 – 5,7) mudah terjangkit penyakit kudis. Intensitas
penyakit busuk akar pada tembakau yang disebabkan oleh Thielaviopsis
basicola akan menurun jika diberi asam sulfat tetapi akan meningkat jika diberi
asam fosfat. Hal ini menunjukkan bahwa penambahan unsur yang sama ke tanah
dari senyawa yang berbeda akan dapat mengakibatkan perkembangan penyakit
yang berbeda pula.
Parasit yang penularannya lewat tanah kurang dapat bertahan dalam tanah
yang terlalu basah, karena mikroorganisme lain yang bersifat antagonik
(misalnya : Trichoderma, Verticillium) akan menjadi lebih aktif. Tektur tanah
yang lebih ringan akan disukai oleh beberapa parasit seperti nematoda, jamur
akar merah bata (Poria hypolateritia), jamur akar coklat (Phellinus lamaensis),
sedangkan penyakit-penyakit bakteri pada kapas (Xanthomonas malvacearum),
jamur akar merah anggur (Ganoderma pseudoferreum), jamur akar merah ungu
(Spherotilbe repens) banyak terdapat pada tanah bertekstur berat.
Akar tanaman dan patogen tular tanah menempati lingkungan yang sama,
misalnya aerasinya. Perubahan aerasi tanah mungkin akan mempengaruhi
kerentanan tanaman, virulensi patogen atau kedua-duanya, sehingga timbulnya
penyakit akan dipengaruhi oleh keadaan aerasi tanah. Busuk akar tebu yang
disebabkan oleh Pythium arrenomones telah diteliti ada pengaruh ‘salisylic
aldehyde’ yang biasanya terdapat pada tanah-tanah yang drainasenya jelek.
Substansi ini menyebabkan adanya keracunan terhadap tebu dalam konsentrasi
yang relatif tinggi, tetapi mempunyai pengaruh yang kecil dalam konsentrasi
rendah. Namun demikian pengurangan berat tanaman karena inokulasi dengan
jamur tersebut mendekati 6 kali jika ada salisylic aldehyde.
Daerah yang hujannya tidak teratur atau mempunyai periode kering yang
panjang, irigasi merupakan hal yang penting untuk meningkatkan produksi
pertanian. Namun demikian pemberian air akan mempengaruhi kelembaban
tanah dan pada umumnya menambah berat serangan dari patogen tular tanah,
misalnya : Sclerotium rolfsii, Rhizoctonia spp. Irigasi memang memungkinkan
menanam tanaman di luar musim, sehingga rotasi tanaman biasanya kurang
diperhatikan. Hal ini menyebabkan terjadinya serangan yang lebih awal. Oleh
karena itu investasi alat-alat irigasi yang besar hanya menguntungkan jika
tanaman yang akan diusahakan mempunyai nilai pasar yang tinggi dan tindakan
perlindungan tanaman perlu dilakukan seawal mungkin. Untuk penyakitpenyakit
tertentu, misalnya busuk kaki hitam pada Rosela yang disebabkan oleh
Phytophthora parasitica, penggenangan air sedalam 20 cm atau lebih akan
mematikan patogen. Pengenangan satu bulan sebelum ditanami tembakau dapat
sangat mengurangi penyakit lanas yang disebabkan oleh Phytophthora
nicotianae dan membantu perkembangan jamur-jamur antagonis. Namun
demikian jika drainasenya jelek akan merupakan sarang patogen.
Saat menyebar benih, dalamnya menanam dan jarak tanam merupakan
salah satu hal yang harus diperhatikan dalam mengendalikan penyakit tanaman,
karena berpengaruh terhadap lingkungan yang diciptakan dari pertumbuhan
tanaman dan persaingan unsur hara dalam tanah. Banyak tanaman yang lebih
rentan terhadap penyakit pada waktu masih muda. Untuk mengendalikan
penyakit bulai pada jagung dianjurkan untuk menanam jagung lebih awal,
sehingga pada waktu musim banyak hujan, tanaman sudah cukup besar dan
tahan terhadap penyakit bulai. Di Jepang penanaman padi yang lebih awal justru
menambah timbulnya penyakit blast, sebaliknya di Afrika penanaman kacang
tanah yang awal merupakan tindakan pencegahan terhadap penyakit roset yang
disebabkan oleh virus dan ditularkan oleh Aphis.
Penanaman yang terlalu dalam berarti memperbesar kemungkinan
terserang oleh parasit tular tanah, karena kecambah terlalu lama berada di dalam
tanah. Demikian juga penanaman yang terlalu rapat memberikan lingkungan
yang sangat baik kepada parasit-parasit yang perkembangannya dibantu oleh
kelembaban yang tinggi, seperti : Pythium spp. penyebab penyakit busuk
batang, sebaliknya penanaman kacang tanah yang rapat dapat mengurangi
infeksi virus yang ditularkan oleh aphis, menekan persaingan dengan gulma dan
dapat mempertinggi angka hasil.
Pemeliharaan tanaman yang dilakukan oleh petani pada umumnya berupa
perlakukan sanitasi yang kadang-kadang secara tidak sengaja membantu
penyebaran patogen. Sebagai contoh : pada waktu menyiang atau mencari ulat,
penyakit virus yang dapat ditularkan secara mekanik akan meluas, seperti
mosaik tembakau dan belang pada kacang tanah. Dalam penyiangan, kecuali
mengurangi kompetisi antara gulma dengan tanaman inang, sekaligus harus
diperhatikan tumbuhan sebagai inang lain dari vektor atau inang dari
patogennya sendiri. Misalnya untuk mosaik tembakau, tumbuhan inang lain
adalah tomat (Lycopersicon esculentum), ceplukan (Physalis angulaata), terong
(Solanum melongena), ketimun (Cucumis sativus), semangka (Cucumis sp.),
buncis (Phaseolus vulgaris), tembakau liar (Nicotiana glutinosa). Untuk
penyakit krupuk pada tembakau, pembawa patogen (vektor) yang berupa lalat
putih (Bemissia tabaci) dapat bertahan pada gulma wedusan (Ageratum
conyzoides), srunen (Sunedrella nodiflora), dan tomat. Inang dari virus tungro
pada padi antara lain : rumput celulang (Eleusine indica), tuton (Echinochloa
colonum), jawan (Echinochloa crugalli) dan lain-lain. Seperti diketahui bahwa
penyakit virus tungro dan kerdil kuning ditularkan oleh wereng hijau
(Nephotettix impicticeps), sedangkan wereng coklat (Nilaparvata lugens)
menularkan virus kerdil rumput dan kerdil hampa pada padi, sehingga salah satu
pengendalian efektif adalah mengadakan pembersihan rumput-rumput inang
virus dan sisa-sisa tanaman padi.
Pemotongan bibit tebu dapat menyebabkan menularnya penyakit blendok
(Xanthomonas albilineans) yang dapat dicegah dengan mendesinfeksi kapak
atau pemotong dengan lysol. Pemeliharaan bibit maupun tanaman perlu selalu
memperhatikan kebersihan pekerja dengan jalan mengadakan desinfeksi
menggunakan sabun trinatrium fosfat atau zat-zat penyamak untuk membuat
inaktif patogen. Tindakan sanitasi dapat juga dilakukan dengan jalan
membinasakan tanaman yang sakit atau menghilangkan bagian-bagian tanaman
sakit secara hati-hati untuk mengurangi sumber penular, sehingga penyakit tidak
meluas. Misalnya menghilangkan cabang-cabang pohon jeruk yang terserang
Diplodia natalensis, memotong bagian-bagian tanaman yang terserang jamur
upas (Corticium salmonicolor)
Penggunaan pohon pelindung yang sering untuk menambah bahan
organik, mengurangi penguapan dan kadang-kadang untuk memperbaiki
kualitas produksi tanaman (misalnya pada teh), harus diperhitungkan akan
kerimbunannya. Pohon pelindung yang terlalu rimbun akan mempertinggi
kelembaban kebun dan mengurangi masuknya cahaya matahari. Hal ini akan
sangat membantu serangan macam-macam patogen khususnya Exobasidium
vexans penyebab penyakit cacar teh. Demikain juga jenis pohon pelindung perlu
diperhitungkan akan kepekaannya terhadap jamur-jamur akar, serangga vektor
yang dapat menyerang tanaman pokok. Misalnya : Lamtoro (Leucaena glauca)
peka terhadap jamur akar coklat (Phellinus lamaensis), jamur akar hitam
(Rosellinia bunodes), jamur kanker belah (Armilaria melea), jamur leher akar
(Ustulina maxima) yang infeksinya biasanya melalui luka akibat penyiangan.
Pohon pelindung dadap (Erythrina subumbrans) banyak digunakan petani
Bengkulu selatan sebagai pohon pelindung tanaman kopi dan pohon panjat
tanaman lada. Dadap peka terhadap jamur akar coklat, jamur kanker belah,
jamur akar merah, jamur leher akar, dan jamur akar putih.